首先,科学家们在南美洲安第斯山地区,广泛收集了这四种驼驼们的样品,也就是两个驯化物种(羊驼Alpaca和美洲驼Llama),两个野生物种(原驼Guanaco和骆马Vicuna)。
拿到DNA序列之后,做的第一件事儿就是使用系统树构建,描绘了他们之间的进化关系,我们先记为A树。但是,这个A树长得有点奇怪:原驼(Guanaco)和骆马(Vicuna)这两个野生物种分开很久了,这个可以理解,毕竟是两个野生物种。
美洲驼(Llama)是原驼(Guanaco)的后代,这个也没太大争议,之前的研究也比较支持这个结论。
但是,但是!羊驼却比骆马(Vicuna)的进化关系更久远,看着好像是骆马(Vicuna)是从羊驼里驯化出来的一样。这在逻辑上是说不通的:野生物种怎么会是驯化物种的后代?
于是,科学家们又做了一个遗传结构的分析,计算了他们每个个体的祖先成分比例,这才找到原因。
原来羊驼(Alpaca)的DNA成分里,有36%左右是从美洲驼(Llama)渗入过来的,这样就很可能造成羊驼(Alpaca)和美洲驼(Llama)在A树上更靠近一些,让人觉得骆马(Vicuna)是从羊驼(Alpaca)里驯化出来的假象。
那么,大家会想,假如把这些渗入过来的DNA片段都去掉,是不是就正常了?

科学家们其实也是这么想的……
因此,科学家们通过“局部祖先推断”的操作,又进一步将这些DNA片段屏蔽掉之后,发现果然正常了!
不仅如此,科学家们通过模型计算发现,美洲驼(Llama)给了羊驼大约36%的DNA,羊驼(Alpaca)还回赠了美洲驼(Llama)大约5%的DNA。这些大范围的“礼尚往来”才造就了以往研究们的不一致。
那么,知道了“我是谁”的问题之后,科学家又有了新的疑问:这种“礼尚往来”是什么时候的事情?又是如何发生的?(有没有人强迫它们?)
为了找到这个问题的答案,科学家统计了这些DNA片段的长度,通过构建一种叫“重组-衰减”的统计模型,计算了“礼尚往来”发生的最可能时间。
结果发现,两次时间比较接近,都是在大约500年前!也就是十六世纪30年代。(羊驼os:500年了,你们还是给发现了!)
那500年前到底发生了什么?

翻开历史课本发现,十六世纪30年代,对南美洲来说,是文明发展史上非常关键的一个时期,甚至可以说,改变了南美洲的文明发展轨迹!
在十六世纪之前,统治南美洲的一直是印加帝国。印加帝国塑造了曾经非常辉煌的印加文明,与玛雅文明、阿斯特克文明并称为“美洲三大文明”。
但是随着哥伦布1492年发现美洲大陆,欧洲人开启了殖民扩张浪潮。正是在十六世纪30年代,西班牙人到达南美洲。
两军相遇,必有一战。这场战争,可以说是毫无悬念。我们可以想象一下,面对枪炮和铁骑加成的西班牙人,甚至都没有“骑兵”(的印第安人,几乎没有招架之力。西班牙人很轻松就征服了南美洲,开启了南美殖民时代。由此也可以看出,动物的驯化,对人类社会文明的发展是多么重要!
西班牙人占领之后,不仅对印第安人大肆屠杀,动物亦不放过。科研人员通过对种群动态历史大小的推断,也确实证实了羊驼数量在当时加速下降。
同时,对于羊驼(Alpaca)和美洲驼(Llama),西班牙人其实也傻傻分不清。搞得这两种驼都是混养在一起。这种混乱的管理方式,造成了我们以上看到的大范围基因渗入(“礼尚往来”)现象。
尽管西班牙征服者的到来给当地传统的羊驼管理方式造成了不小的冲击,但令人欣慰的是,从此羊驼这个物种,也从南美洲走向了世界!
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